Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.2 ms