Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Chrac1Q9JKP8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Chrac1Q9JKP8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms