Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms