Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms