Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp29Q9ES63 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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