Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Wdr61Q9ERF3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms