Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnft1Q9DCN7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms