Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Swt1Q9DBQ9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Swt1Q9DBQ9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms