Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ift46Q9DB07 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms