Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms