Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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