Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms