Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2cQ9D1C1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms