Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms