Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms