Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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