Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms