Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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