Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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