Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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