Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sf3b5Q923D4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sf3b5Q923D4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sf3b5Q923D4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sf3b5Q923D4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sf3b5Q923D4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sf3b5Q923D4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sf3b5Q923D4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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