Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms