Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sgms1Q8VCQ6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgms1Q8VCQ6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgms1Q8VCQ6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgms1Q8VCQ6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgms1Q8VCQ6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms