Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms