Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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