Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms