Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab11fip3Q8CHD8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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