Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms