Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ang-201ENSMUST00000069011 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trim35Q8C006 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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