Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ctdsp2Q8BX07 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ctdsp2Q8BX07 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ctdsp2Q8BX07 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ctdsp2Q8BX07 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ctdsp2Q8BX07 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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