Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp38Q8BW70 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp38Q8BW70 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp38Q8BW70 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp38Q8BW70 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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