Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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