Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cyp4f39Q8BGU0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cyp4f39Q8BGU0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cyp4f39Q8BGU0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cyp4f39Q8BGU0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cyp4f39Q8BGU0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms