Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms