Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms