Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Avl9Q80U56 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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