Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NischQ80TM9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
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