Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms