Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx13Q6PHS6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms