Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtifQ6PEE2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms