Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp40Q6PE01 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp40Q6PE01 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp40Q6PE01 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Snrnp40Q6PE01 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp40Q6PE01 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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