Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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