Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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NipblQ6KCD5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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NipblQ6KCD5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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NipblQ6KCD5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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NipblQ6KCD5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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NipblQ6KCD5 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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