Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Krt77Q6IFZ6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Krt77Q6IFZ6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms