Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q6DFW0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms