Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Jmjd1cQ69ZK6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Jmjd1cQ69ZK6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms