Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Pkp4Q68FH0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Pkp4Q68FH0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Pkp4Q68FH0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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