Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Sbno1Q689Z5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sbno1Q689Z5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Sbno1Q689Z5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Sbno1Q689Z5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sbno1Q689Z5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Sbno1Q689Z5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Sbno1Q689Z5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbno1Q689Z5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Sbno1Q689Z5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Sbno1Q689Z5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms