Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ctnna3Q65CL1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ctnna3Q65CL1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctnna3Q65CL1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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