Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf2Q64705 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf2Q64705 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf2Q64705 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Usf2Q64705 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf2Q64705 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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